สำนักงานคลังจังหวัดปราจีนบุรี เป็นส่วนราชการส่วนภูมิภาค สังกัดกรมบัญชีกลาง กระทรวงการคลัง เดิมตั้งอยู่ที่อาคารศาลากลางจังหวัดปราจีนบุรี ตำบลหน้าเมือง อำเภอเมือง จังหวัดปราจีนบุรี ต่อมาจังหวัดปราจีนบุรี ได้ตั้งศูนย์ราชการแห่งใหม่ จึงได้ย้ายสำนักงานคลังจังหวัดปราจีนบุรีไปอยู่ที่อาคารศูนย์ราชการจังหวัดปราจีนบุรี ถนนสุวินทวงศ์ ตำบลไม้เค็ด อำเภอเมือง จังหวัดปราจีนบุรี

    ปัจจุบันสำนักงานคลังจังหวัดปราจีนบุรี ได้ดำเนินการปรับปรุงสำนักงานตามโครงการปรับปรุงสำนักงานเพื่อรองรับการปรับบทบาทของสำนักงานคลัง และได้เปิดสำนักงานใหม่ เมื่อวันที่ 28 มีนาคม 2561